Abstract in English:
Araucaria angustifolia (“pine tree”) is an evergreen tree from the South region of Brazil. Its sharp, leathery leaves (3–5 cm long) penetrate the nostrils and, once inhaled, are difficult to expel. Reports of A. angustifolia branch aspiration in cattle are scarce. Therefore, this study reports eight cases of this condition in cattle from Santa Catarina state, Brazil, describing its clinical signs, disease progression and presentation, and macroscopic and microscopic findings. Affected cattle ranged in age (4-month to 10-year-old), including dairy 50% (4/8), beef 25% (2/8), and mixed breeds 25% (2/8), from Concórdia (4/8; 50%), Curitibanos (3/8; 37.5%), and São Cristóvão do Sul (1/8; 12.5%) municipalities. Clinical presentations involved peracute (1/8; 12.5%), subacute (2/8; 25%), and chronic (5/8; 62.5%). The peracute form was seen in a 4-month-old calf found dead, with autopsy revealing a 40 cm branch obstructing the trachea and left bronchus. Subacute cases lasted four to seven days, presenting respiratory and systemic clinical signs, and cavitary pneumonia with pine branch fragments observed grossly. Histology revealed extensive areas of pulmonary necrosis with fibrin deposition, suppurative inflammation, bacterial myriads, and plant debris. Chronic cases, lasting two to six months, also exhibited respiratory signs, with post mortem findings mainly characterized by pulmonary abscesses with fragments of the plant, and bronchiectasis in one case. Bacterial cultures from two cases were identified: Trueperella pyogenes and Corynebacterium sp. Therefore, aspiration of A. angustifolia branches is a differential diagnosis in cattle with respiratory disease in the South region of Brazil, where this tree is endemic, underscoring the importance of the accurate clinical and post mortem diagnosis.
Abstract in Portuguese:
Araucaria angustifolia (“pinheiro brasileiro”) é uma árvore perene do Sul brasileiro. Contém folhas aciculares, coriáceas, de 3 a 5 cm de comprimento, que penetram nas narinas e, após inalação, são de difícil eliminação. Relatos de aspiração de galhos de A. angustifolia em bovinos são escassos. Este estudo descreve oito casos dessa condição em bovinos em Santa Catarina, Brasil, abordando os sinais clínicos, apresentação e progressão clínica, e achados patológicos. Bovinos acometidos, entre 4 meses e 10 anos de idade, de raças leiteiras (4/8, 50%), corte (2/8, 25%), e mestiças (2/8, 25%), eram provenientes de Concórdia (4/8, 50%), Curitibanos (3/8, 37.5%) e São Cristóvão do Sul (1/8, 12.5%). Formas clínicas incluíram hiperaguda (1/8, 12.5%), subaguda (2/8, 25%) e crônica (5/8, 62.5%). A forma hiperaguda foi observada em um bezerro encontrado morto, com um galho obstruindo a traqueia e brônquio esquerdo. Casos subagudos persistiram de quatro a sete dias, com sinais clínicos respiratórios, e lesões macroscópicas de pneumonia cavitária com fragmentos da planta. Microscopicamente, observaram-se áreas de necrose pulmonar com deposição de fibrina, inflamação neutrofílica, bactérias cocóides e fragmentos vegetais. Casos crônicos duraram dois a seis meses, também apresentando sinais respiratórios, com abscessos pulmonares associados a fragmentos da planta e bronquiectasia em um dos animais. Houve isolamento bacteriano de Trueperella pyogenes e Corynebacterium sp. em dois casos. A aspiração de galhos de A. angustifolia é um diagnóstico diferencial em bovinos com doença respiratória no Sul do Brasil, onde essa árvore é endêmica, ressaltando a importância do diagnóstico clínico e post mortem preciso.
Abstract in English:
This study aimed to compare the early-phase histopathological and immunohistochemical effects of platelet-rich plasma (PRP) and platelet-rich fibrin (PRF) following their application in the inflammatory phase of experimentally induced calcaneal tendon injuries in a rabbit model. A complete calcaneal tenotomy was performed and repaired using the modified Kessler technique. In the PRP group, 0.5–1 ml of non-activated liquid PRP was injected into the paratenon. In the PRF group, a PRF membrane was wrapped around the tenotomy site. The Control group received sutures only. On the 14th postoperative day, tendon tissue samples were collected for analysis. Healing was assessed via histopathology (HE, Masson’s trichrome) and immunohistochemistry for key growth factors (TGF-β, VEGF, FGF-β) and inflammatory markers (iNOS, nitrotyrosine). Histopathological evaluation revealed that both PRP and PRF groups exhibited superior healing compared to the Control group, characterized by reduced inflammatory cell infiltration, less edema, and a more organized, parallel arrangement of newly synthesized collagen fibers. Compared to controls, both treatment groups showed significantly increased expression of the pro-regenerative FGF-β and decreased expression of TGF-β and VEGF. Furthermore, levels of iNOS and nitrotyrosine were markedly lower in the PRP and PRF groups. Both PRP and PRF demonstrated comparable and significant efficacy in enhancing the quality of early tendon repair. Their therapeutic effect appears to be multifactorial, created by a pro-regenerative and anti-inflammatory microenvironment that favorably modulates growth factor expression and reduces inflammatory tissue damage. These findings support the use of both preparations as effective strategies to promote healing in acute tendon injuries.
Abstract in Portuguese:
Este estudo teve como objetivo comparar os efeitos histopatológicos e imuno-histoquímicos de fase inicial do plasma rico em plaquetas (PRP) e fibrina rica em plaquetas (PRF) após a sua aplicação na fase inflamatória de lesões do tendão calcâneo, induzida experimentalmente em um coelho. Uma tenotomia completa do calcâneo foi realizada e reparada através da técnica de Kessler modificada. No grupo PRP, foram injetados 0,5–1 ml de PRP líquido não ativado no espaço do paratendão. No grupo PRF, uma membrana de PRF foi enrolada em torno do local da tenotomia. O Grupo controle recebeu apenas suturas. No 14º dia pós-operatório, os tecidos tendinosos foram recolhidos para análise. A cicatrização foi avaliada por histopatologia (HE, tricrômico de Masson) e imunohistoquímica para fatores de crescimento chave (TGF-β, VEGF, FGF-β) e marcadores inflamatórios (iNOS, nitrotirosina). A avaliação histopatológica revelou que ambos os grupos, PRP e PRF, apresentaram uma cicatrização superior em comparação com o Grupo controle, caracterizada por uma menor infiltração de células inflamatórias, menos edema e um arranjo paralelo mais organizado das fibras de colágeno recém-sintetizadas. Em comparação com os controles, ambos os grupos de tratamento apresentaram uma expressão significativamente aumentada do pró-regenerador FGF-β e uma expressão diminuída de TGF-β e VEGF. Além disso, os níveis de iNOS e nitrotirosina foram significativamente mais baixos nos grupos PRP e PRF. Tanto o PRP como o PRF demonstraram uma eficácia comparável e significativa na melhoria da qualidade da reparação precoce do tendão. O seu efeito terapêutico parece ser multifatorial, envolvendo a criação de um microambiente pró-regenerador e anti-inflamatório, modulando favoravelmente a expressão do fator de crescimento e reduzindo os danos inflamatórios nos tecidos. Estes achados corroboram a utilização de ambas as preparações como estratégias eficazes para promover a cicatrização em lesões agudas do tendão.
Abstract in English:
Inclusion body disease (IBD) is a global viral infectious disease that affects snakes, mainly from the Boidae and Pythonidae families. The appearance of secondary infections is common in cases of IBD. The aim of this study was to report a case of inclusion body disease (IBD) associated with secondary infection in the respiratory system by Salmonella spp. in a captive Boa constrictor in the state of Ceará, northeastern Brazil. A male captive snake from a private captivity was sent for necropsy after presenting apathy and anorexia. It was sent for necropsy to the “Laboratório de Anatomia e Fisiologia Animal” at the “Universidade Federal do Cariri.” Macroscopically, there was a discrete focal brownish catarrhal content in the tracheal lumen. The lungs, especially the right one, were reddish, with multifocal to coalescing yellowish areas. On the cut surface, these areas extended to the lung parenchyma. They were soft, yellow and had a pasty texture. A brownish catarrhal exudate was also observed in the lung cavity. Microbiological examination of the tracheal swab and lungs resulted in the isolation of Salmonella spp. as well as Achromobacter denitrificans in the trachea. Fragments from all organs were collected, fixed in 10% buffered formalin solution and routinely processed to make histological slides stained with hematoxylin and eosin (HE). Microscopically, there was lymphoplasmacytic and heterophilic tracheitis, with hyperplasia of the mucosal epithelium associated with intracytoplasmic eosinophilic inclusion bodies. In the lungs, there was granulomatous pneumonia. The faveolar epithelium showed degeneration and necrosis associated with intracytoplasmic eosinophilic inclusion bodies. In the intestine, there was necrotic enteritis. In the liver there was random necrotic hepatitis. In the kidneys, there was degeneration and necrosis of the tubular epithelium and interstitial nephritis. Round to oval, intracellular eosinophilic to amphophilic inclusion bodies were also seen in the pancreas, liver, bile ducts, kidneys, and brain. Paraffin blocks of lung and intestine fragments were sent to the Veterinary Pathology Department at “Universidade Federal do Rio Grande do Sul” for immunohistochemistry with anti-Salmonella antibody, with positive immunostaining. The findings of inclusion bodies were consistent with infection by a virus of the genus Reptarenavirus. This appears to be the first reported case of IBD in a Boa constrictor from a private zoo in the state of Ceará, northeastern Brazil. In the present report, the disease was associated with secondary infection in the respiratory system by Salmonella sp. Additionally, this seems to be the first report of isolation of A. denitrificans from the microbiome of a respiratory sample in a snake in Brazil. Although Salmonella spp. infections are common in snakes, the isolation of A. denitrificans requires further studies on infection routes, pathogenicity and antimicrobial sensitivity.
Abstract in Portuguese:
A doença do corpúsculo de inclusão (“Inclusion Body Disease” – IBD) é uma doença infecciosa viral e de caráter global que acomete serpentes, principalmente das famílias Boidae e Pythonidae. O surgimento de infecções secundárias é comum em casos de IBD. Objetivou-se com este trabalho, relatar um caso da doença de corpúsculos de inclusão (IBD) associada a infecção secundária do sistema respiratório por Salmonella spp. em uma jiboia (Boa constrictor) de cativeiro, no estado do Ceará, nordeste do Brasil. Uma serpente, macho, proveniente de cativeiro particular foi encontrada morta em seu recinto após apresentar apatia e anorexia, e encaminhada para necropsia no Laboratório de Anatomia e Fisiologia Animal na Universidade Federal do Cariri. Macroscopicamente, no lúmen da traqueia havia conteúdo catarral acastanhado focal discreto. Os pulmões, principalmente o direito, estava avermelhado, com áreas multifocais a coalescentes amareladas. Ao corte, estendiam-se ao parênquima pulmonar, eram macias, amarelas e de consistência pastosa e na cavidade pulmonar havia exsudato catarral acastanhado. O exame microbiológico foi feito a partir de swab traqueal e pulmão resultou em isolamento de Salmonella spp., além de Achromobacter denitrificans em traqueia. Foram colhidos fragmentos de todos os órgãos, fixados em solução de formalina tamponada a 10% e, em seguida, processados rotineiramente para fazer confecção de lâminas histológicas coradas com hematoxilina e eosina (HE). Microscopicamente, havia traqueíte linfoplasmocitária e heterofílica com hiperplasia do epitélio da mucosa associada a corpúsculos de inclusão intracitoplasmáticos. No pulmão, havia pneumonia granulomatosa. No epitélio faveolar foi visto degeneração e necrose associada a corpúsculos de inclusão eosinofílicos intracitoplasmáticos. No intestino havia enterite necrótica. No fígado havia hepatite necrótica, aleatória. Nos rins, havia degeneração, necrose do epitélio tubular e nefrite intersticial linfoplasmocitária. Corpúsculos de inclusão eosinofílicos a anfofílicos, redondos a ovais, intracitoplasmáticos foram vistos ainda em pâncreas, fígado, ductos biliares, rins e encéfalo. Blocos de parafina de fragmentos de pulmão e intestino foram encaminhados ao Setor de Patologia Veterinária da Universidade Federal do Rio Grande do Sul para realização de imuno-histoquímica com anticorpo anti-Salmonella, com imunomarcação positiva. Os achados de corpúsculos de inclusões foram compatíveis com infecção por vírus do gênero Reptarenavirus. Este parece ser o primeiro relato de caso de doença do corpúsculo de inclusão em uma jiboia de um zoológico particular no estado do Ceará, Nordeste do Brasil. No presente relato, a doença foi associada à infecção secundária no sistema respiratório por Salmonella sp. Além disso, este parece ser o primeiro relato de isolamento de A. denitrificans do microbioma de uma amostra respiratória em uma serpente no Brasil. Embora infecções por Salmonella spp. sejam comuns em serpentes, o isolamento de A. denitrificans requer mais estudos sobre as vias de infecção, patogenicidade e sensibilidade antimicrobiana.
Abstract in English:
Swinepox (SWPV), caused by Suipoxvirus, primarily affects pigs and typically presents progressive skin lesions. This study aims to describe and characterize an outbreak of SWPV on four subsistence-farming properties in the state of Santa Catarina, South region of Brazil. Clinical, histopathological, molecular, and immunohistochemical analyses were performed on skin samples from one pig per property. The outbreak involved four subsistence pig farms, affecting the herds with proliferative, crusted skin lesions. Skin samples from four pigs, one from each property, were collected and routinely processed for histopathological analysis. Immunohistochemistry (IHC) was performed using the peroxidase method with a polyclonal vaccinia virus antibody, and the Max Polymer Detection System was utilized. Frozen skin fragments underwent polymerase chain reaction (PCR) for Suipoxvirus, targeting the FP-DNApol/RP-DNApol sequences, amplifying 543 base pairs. Sequencing and phylogenetic analysis were performed using the Sanger method. The farm facilities were located near water reservoirs, where constant flies and mosquitoes plagued. The number of affected pigs was 14, 9, 21 and 2, respectively, in the four farms, resulting in 98% morbidity; however, no pig died. Macroscopically, erythematous and crusted lesions with a crateriform appearance were observed on the dorsal, ventral and limb regions, as well as the face, ears, and snout, associated with intense pruritus. Histopathology revealed proliferative pustular ulcerative dermatitis with eosinophilic intracytoplasmic inclusion bodies. The IHC showed positivity in the cytoplasm of epithelial cells for poxvirus 1/4, and the PCR was positive for SWPV in 3/4 cases. The phylogenetic analysis revealed 75% similarity with previously described Brazilian strains. After three weeks, the affected animals experienced spontaneous recovery from the disease. This study emphasizes the significance of disease monitoring in subsistence pig farming, particularly for differential diagnoses, as the observed lesions are suggestive of other viral agents, such as foot-and-mouth disease.
Abstract in Portuguese:
A varíola suína (SWPV), causada pelo Suipoxvirus, afeta principalmente os suínos e geralmente se manifesta por lesões cutâneas progressivas. Este estudo tem como objetivo descrever e caracterizar um surto de SWPV em quatro propriedades de subsistência no estado de Santa Catarina, Sul do Brasil. Foram realizadas análises clínicas, histopatológicas, moleculares e imuno-histoquímicas em amostras de pele de um suíno por propriedade. O surto envolveu quatro criações de subsistência, cujos rebanhos apresentaram lesões cutâneas proliferativas e crostosas. Amostras de pele de quatro suínos, sendo um de cada propriedade foram coletadas e processadas rotineiramente para análise histopatológica. A imuno-histoquímica (IHQ) foi conduzida pelo método da peroxidase, utilizando anticorpo policlonal para o vírus vaccinia com o sistema Max Polymer Detection. Fragmentos de pele congelados foram submetidos à reação em cadeia da polimerase (PCR) para Suipoxvirus, com alvo nas sequências FP-DNApol/RP-DNApol, amplificando 543 pares de bases. O sequenciamento e a análise filogenética foram realizados pelo método de Sanger. As instalações das propriedades estavam próximas a reservatórios de água, com presença constante de moscas e mosquitos. O número de suínos afetados foi de 14, 9, 21 e 2, respectivamente, nas quatro propriedades, atingindo até 98% de morbidade; entretanto, nenhum animal morreu. Macroscopicamente, observaram-se lesões eritematosas e crostosas, de aspecto crateriforme, localizadas em dorso, abdômen, membros, face, orelhas e focinho, associadas a intenso prurido. A histopatologia revelou dermatite pustular proliferativa e ulcerativa, com inclusões intracitoplasmáticas eosinofílicas. A IHQ mostrou marcação positiva no citoplasma das células epiteliais para poxvírus em 1/4 dos casos, e a PCR foi positiva para SWPV em 3/4. A análise filogenética revelou 75% de similaridade com cepas brasileiras previamente descritas. Após três semanas, os animais afetados apresentaram recuperação espontânea da doença. Este estudo ressalta a importância da vigilância sanitária na suinocultura de subsistência, sobretudo para diagnósticos diferenciais, uma vez que as lesões observadas podem ser sugestivas de outros agentes virais, como o vírus da febre aftosa.
Abstract in English:
The Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii (Acb) complex is a major concern in veterinary medicine due to its intrinsic resistance to various antimicrobial agents, including ampicillin, amoxicillin, amoxicillin-clavulanate, and carbapenems. The increasing prevalence of multidrug-resistant (MDR) strains, particularly those producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) and carbapenemases, has been observed in animals, with a significant number of urinary tract infections being associated with these pathogens. The present study identified Acb complex strains harboring one or more resistance genes for ESBL and carbapenemase production, highlighting the growing issue of bacterial resistance in veterinary clinical practice. Phenotypic resistance profiling revealed that some Acinetobacter complex strains can hydrolyze a wide range of beta-lactams, including penicillins and third- and fourth-generation cephalosporins, while remaining resistant to cephamycins and carbapenems. Most of the ESBLs belong to Ambler’s class A, and these enzymes can be inhibited by clavulanic acid, sulbactam, tazobactam, and avibactam. The spread of these resistant strains is largely attributed to clonal expansion and horizontal gene transfer, with CTX-M, SHV, and TEM-derived ESBLs being the most clinically significant. Despite advances in molecular diagnostic methods, correlating phenotypic and genotypic data remains a significant challenge. The present findings highlight discrepancies between the phenotypic resistance patterns and the presence of resistance genes, illustrating the complexity of diagnosing and treating infections caused by Acinetobacter species. Further studies are necessary to better understand the mechanisms of resistance, improve diagnostic accuracy, and address the increasing threat of MDR bacteria in the veterinary field.
Abstract in Portuguese:
O complexo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii (Acb) é uma grande preocupação na medicina veterinária devido à sua resistência intrínseca a diversos agentes antimicrobianos, incluindo ampicilina, amoxicilina, amoxicilina-clavulanato e carbapenêmicos. A crescente prevalência de cepas multirresistentes (MDR), especialmente aquelas produtoras de beta-lactamases de espectro estendido (ESBLs) e carbapenemases, tem sido observada em animais, com um número significativo de infecções do trato urinário associadas a esses patógenos. O presente estudo identificou cepas do complexo Acb que abrigam um ou mais genes de resistência responsáveis pela produção de ESBLs e carbapenemases, destacando o crescente problema da resistência bacteriana na prática clínica veterinária. A análise fenotípica da resistência revelou que algumas cepas do complexo Acinetobacter são capazes de hidrolisar uma ampla gama de beta-lactâmicos, incluindo penicilinas e cefalosporinas de terceira e quarta geração, permanecendo resistentes às cefamicinas e aos carbapenêmicos. A maioria das ESBLs pertence à classe A de Ambler, e essas enzimas podem ser inibidas por ácido clavulânico, sulbactam, tazobactam e avibactam. A disseminação dessas cepas resistentes é atribuída, em grande parte, à expansão clonal e à transferência horizontal de genes, sendo as ESBLs derivadas dos genes CTX-M, SHV e TEM as mais clinicamente relevantes. Apesar dos avanços nos métodos moleculares de diagnóstico, correlacionar os dados fenotípicos e genotípicos ainda é um grande desafio. Os achados deste estudo evidenciam discrepâncias entre os padrões fenotípicos de resistência e a presença de genes de resistência, ilustrando a complexidade do diagnóstico e tratamento de infecções causadas por espécies de Acinetobacter. Estudos adicionais são necessários para compreender melhor os mecanismos de resistência, melhorar a precisão diagnóstica e enfrentar a crescente ameaça das bactérias multirresistentes no campo veterinário.
Abstract in English:
We investigated the microbiological etiology of umbilical infections in clinically scored lambs. A total of 128 lambs showing signs of umbilical infection and 41 showing no umbilical signs were sampled. All microorganisms were identified by mass spectrometry (MALDI-TOF MS), and the in vitro antimicrobial susceptibility/resistance patterns of bacteria were assessed. Among the diseased animals and those without umbilical signs, 214 and 116 species of microorganisms (bacteria and yeasts) were identified, respectively. Escherichia coli (11.21%) was the most prevalent microorganism and showed a significant association (p = 0.0039) with moderate (score 2) and severe (score 3) scores for umbilical infection. In lambs without clinical signs of umbilical infection, a predominance of Desemzia incerta was observed. Diseased lambs that exhibited clinical complications showed a high mortality rate (58%). Additionally, a significant association (p < 0.001) was observed between moderate and severe scores and poor prognosis. Bacterial multidrug resistance was observed in 20% (36/182) of isolates. To our knowledge, some bacteria were identified for the first time as primary agents of umbilical infections in lambs, and clinical scoring was applied for the first time in newborn lambs with omphalopathies. Our findings reveal a high complexity of microorganisms in umbilical infections in lambs, identified by mass spectrometry, with a predominance of E. coli in cases of moderate to severe severity scores, and an association between clinical complications and high mortality.
Abstract in Portuguese:
A etiologia microbiana das infecções umbilicais em cordeiros, com avaliação dos escores de gravidade clínica, foi investigada em 128 animais com sinais de infecção umbilical e 41 aparentemente sadios. Todos os microrganismos foram identificados por espectrometria de massas (MALDI-TOF MS), assim como foi investigado o perfil in vitro de sensibilidade/resistência aos antimicrobianos dos isolados bacterianos. Nos animais com e sem infecção umbilical foram identificadas 214 e 116 espécies de microrganismos (bactérias e leveduras), respectivamente. Escherichia coli (11,21%) foi o microrganismo mais prevalente e mostrou associação significante (p = 0,0039) com escores moderados (escore 2) e graves (escore 3) para infecção umbilical. Em cordeiros sem sinais clínicos de infecção umbilical observou-se o predomínio de Desemzia incerta. Cordeiros com infecção umbilical que apresentaram complicações clínicas apresentaram elevada mortalidade (58%). Foi observada ainda associação significante (p < 0,001) entre escores de gravidade clínica moderado e grave e prognóstico desfavorável. A multirresistência bacteriana foi observada em 20% (36/182) dos isolados. Na literatura consultada, certas bactérias foram identificadas pela primeira vez como agentes primários de infecções umbilicais em cordeiros, bem como escores de gravidade clínica foram adotados pioneiramente em cordeiros neonatos com onfalopatias. O presente estudo revelou alta complexidade de microrganismos nas infecções umbilicais em cordeiros indetificados por espectrometria de massas, com predomínio de E. coli nos casos moderados e graves e alta taxa de mortalidade nas infecções umbilicais com complicações clínicas.
Abstract in English:
Infectious bursal disease virus (IBDV) causes immunosuppression in broilers by affecting the bursa of Fabricius. IBDV strains were classified into seven genogroups based on the amino acid composition of the hypervariable region of the VP2 capsid protein. This study aimed to detect and genotype IBDV strains in bursal samples from broilers in Rio de Janeiro and evaluate the genetic variability of the vp2 gene. Sixty-five bursal tissue samples from broilers suspected to have IBD were collected from four farms in Rio de Janeiro and stored in RNAlater. RNA was extracted using TRIzol reagent, and genotyping was performed using RT-qPCR. The VP2 hypervariable region was amplified using conventional PCR, purified, and sequenced. Phylogenetic analysis was conducted using the maximum likelihood method with the Kimura 2-parameter substitution model. IBDV was detected in 75.38% (49/65) of the samples, with 8.16% (4/49) classified as very virulent (vvIBDV) and 91.84% (45/49) as non-vvIBDV strains. This study seems to be the first report of G-3 infection in the state of Rio de Janeiro. Sequence comparison identified multiple missense mutations, including 20 in genogroup 4 and eight in genogroup 3, relative to the reference strain Edgar-USA. The genetic distances among the isolates suggest potential viral evolution and adaptation. These findings highlight the genetic diversity of IBDV in this region and reinforce the importance of continuous molecular surveillance of the virus. The detection of vvIBDV in a previously unreported area underscores the need for monitoring strategies to mitigate the impact of emerging strains on poultry production. Further studies focusing on antigenic variation and vaccine efficacy are essential to ensure effective control of IBDV.
Abstract in Portuguese:
O vírus da doença infecciosa da bursa (VDIB) causa imunossupressão em frangos de carne, afetando a bursa de Fabricius. As estirpes do VDIB foram classificadas em sete genogrupos com base na sua composição de aminoácidos na região hipervariável da proteína VP2 do capsídeo viral. O objetivo deste estudo foi detectar e realizar a genotipagem de cepas de VDIB em amostras de bursa de frangos de corte no Rio de Janeiro e avaliar a variabilidade genética do gene vp2. Sessenta e cinco amostras de tecido da bursa de Fabricius de frangos com suspeita de DIB foram coletadas em quatro granjas do Rio de Janeiro e armazenadas em RNAlater. O RNA foi extraído usando o reagente TRIzol, e a genotipagem foi realizada usando RT-qPCR. A região hipervariável da VP2 foi amplificada por PCR convencional, purificada e sequenciada. A análise filogenética foi efetuada utilizando o método da máxima verosimilhança com o modelo de substituição Kimura-2 parâmetros. O VDIB foi detectado em 75,38% (49/65) das amostras, com 8,16% (4/49) classificadas como muito virulentas (vvVDIB) e 91,84% (45/49) como estirpes não vvVDIB. Este estudo parece ser o primeiro relato de infeção por vvVDIB no estado do Rio de Janeiro. A comparação de sequências identificou múltiplas mutações de sentido trocado, incluindo 20 mutações no genogrupo 4 e oito no genogrupo 3 em relação à estirpe de referência Edgar-USA. As distâncias genéticas entre os isolados sugerem uma evolução potencial e adaptação viral. Estes resultados realçam a diversidade genética do VDIB nesta região e reforçam a importância da vigilância molecular contínua. A deteção do vvVDIB numa área anteriormente não registada sublinha a necessidade de estratégias de monitorização para mitigar o impacto das estirpes emergentes na produção avícola. São essenciais mais estudos centrados na variação antigênica e na eficácia da vacina para garantir medidas de controle eficazes contra o VDIB.
Abstract in English:
Bovine respiratory disease is a multifactorial syndrome of complex etiology, involving interactions among bacterial and viral agents, and has a significant impact on the cattle industry worldwide. This study aimed to identify agents associated with respiratory infections in dairy herds in São Paulo (SP) and Rio Grande do Sul (RS) states. Nasal swabs obtained from animals with and without nasal/respiratory signs in 10 herds in SP (n = 178) and nine herds in RS (n = 273) were submitted to nucleic acid extraction and to endpoint multiplex reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR)/PCR assays for bacterial and viral agents. The bacterial multiplex PCR covers four bacteria (Histophilus somni, Mannheimia haemolytica, Mycoplasma bovis and Pasteurella multocida); the viral multiplex encompasses seven viruses (bovine herpesvirus 1 – BoAHV-1; bovine viral diarrhea virus 1 and 2 – BVDV-1, BVDV-2; HoBi-like pestivirus – HoBiPeV; bovine respiratory syncytial virus – BRSV; bovine parainfluenza 3 virus – BPIV-3 and bovine coronavirus – BCoV). The overall frequency of positive samples was 23.7% (107/451) and the most frequently detected agents were H. somni (30.8%, 33/107) and M. bovis (21.5%, 23/107), followed by BCoV (19.6%, 21/107), BPIV-3 (13.1%, 14/107), M. haemolytica (11.2%, 12/107) and BRSV (9.3%, 10/107). Mixed infections were detected in 13.1% samples (14/107), especially involving bacteria of the Pasteurellaceae family, but also BCoV and BRSV. Considering herd prevalence, H. somni was detected in 57.9% herds (11/19), M. bovis in 52.6% (10/19), M. haemolytica in 42.1% (8/19), BPIV-3 in 36.8% (7/19), BCoV in 26.3% (5/19), BoAHV-1 and BRSV in 21% (4/19), P. multocida in 15.8% (3/19) and BVDV in 5.3% (1/19) herds. Overall, these results offer an overview of the main viral and bacterial agents associated with respiratory infection in dairy herds in the studied regions (SP and RS). In addition, the complex etiology of respiratory disease in cattle highlights the importance of employing multi-etiological diagnostic approaches for comprehensive and accurate investigation.
Abstract in Portuguese:
A doença respiratória bovina é uma síndrome multifatorial de etiologia complexa que envolve interações entre agentes bacterianos e virais, com impacto significativo na indústria pecuária mundial. Este estudo teve como objetivo identificar os agentes relacionados à infecção respiratória em rebanhos leiteiros nos estados de São Paulo (SP) e Rio Grande do Sul (RS). Suabes nasais obtidos de animais com ou sem sinais nasais/respiratórios em dez rebanhos em SP (n = 178) e nove rebanhos no RS (n = 273) foram submetidos à extração de ácidos nucleicos e a testes de transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (RT-PCR)/PCR multiplex convencional para agentes bacterianos e virais. O PCR multiplex bacteriano abrange quatro espécies de bactérias (Histophilus somni, Mannheimia haemolytica, Mycoplasma bovis e Pasteurella multocida); o multiplex viral é capaz de detectar sete vírus (herpesvírus bovino 1 – BoAHV-1; vírus da diarreia viral bovina 1 e 2 – BVDV-1, BVDV-2; pestivírus HoBi-like – HoBiPeV; vírus sincicial respiratório bovino – BRSV; vírus da parainfluenza bovina 3 – BPIV-3 e coronavírus bovino – BCoV). A frequência de amostras positivas foi de 23,7% (107/451) e os agentes mais frequentemente detectados foram H. somni (30,8%; 33/107) e M. bovis (21,5%; 23/107), seguidos por BCoV (19,6%; 21/107), BPIV-3 (13,1%; 14/107), M. haemolytica (11,2%; 12/107) e BRSV (9,3%; 10/107). Infecções mistas foram detectadas em 13,1% das amostras (14/107), especialmente envolvendo bactérias da família Pasteurellaceae, mas também BCoV e BRSV. Considerando a prevalência de rebanhos, H. somni foi detectado em 57,9% dos rebanhos (11/19), M. bovis em 52,6% (10/19), M. haemolytica em 42,1% (8/19), BPIV-3 em 36,8% (7/19), BCoV em 26,3% (5/19), BoAHV-1 e BRSV em 21% (4/19), P. multocida em 15,8% (3/19) e BVDV em 5,3% (1/19) dos rebanhos. No geral, esses resultados fornecem uma visão geral dos principais agentes virais e bacterianos associados com infecção respiratória em rebanhos leiteiros nas regiões estudadas (SP e RS). Além disso, a etiologia complexa das doenças respiratórias em bovinos justifica o uso abordagens diagnósticas multietiológicas, capazes de fornecer um diagnóstico mais abrangente e preciso.
Abstract in English:
One of the most important pathogens of bovine mastitis, Staphylococcus aureus, often shows antibiotic resistance due to the widespread use of antibiotics in dairy herds. Here, we analyzed S. aureus isolates recovered from milk samples of mastitis-affected cows from various dairy farms for the presence of specific antibiotic resistance genes (mecA, blaZ, aacA-aphD, tetK, tetM, vanA, cfr, fusB, and ileS). To isolate and identify S. aureus, milk was inoculated onto Baird-Parker agar plates. The thermonuclease gene (nuc) was used for molecular identification of each S. aureus isolate. The chosen resistance genes were found in 14 verified isolates. The blaZ and tetM genes were found in all isolates (100%), whereas the aacA-aphD, mecA, and cfr genes were found in 42.9%, 14.3%, and 7.1% of the isolates, respectively. TetK, vanA, fusB, and ileS genes were not found in any of the isolates. Every isolate carried at least blaZ and tetM, demonstrating the widespread co-carriage of several genes. The findings show that S. aureus from bovine mastitis in this area exhibits broad genotypic resistance to β-lactams and tetracyclines, and emphasize the need for ongoing regional surveillance of resistance determinants.
Abstract in Portuguese:
Staphylococcus aureus, um dos patógenos mais importantes da mastite bovina, frequentemente apresenta resistência aos antibióticos devido ao uso generalizado de antibióticos em rebanhos leiteiros. Analisamos isolados de S. aureus recuperados de amostras de leite de vacas afetadas por mastite de várias fazendas leiteiras para a presença de genes específicos de resistência aos antibióticos (mecA, blaZ, aacA-aphD, tetK, tetM, vanA, cfr, fusB, e ileS). Para isolar e identificar S. aureus, o leite foi inoculado em placas de ágar Baird-Parker. O gene termonuclease (nuc) foi usado para a identificação molecular de cada isolado de S. aureus. Os genes de resistência escolhidos foram encontrados em 14 isolados verificados. Os genes blaZ e tetM foram encontrados em todos os isolados (100%), enquanto os genes aacA-aphD, mecA e cfr foram encontrados em 42,9%, 14,3% e 7,1% dos isolados, respectivamente. Os genes TetK, vanA, fusB e ileS não foram encontrados em nenhum dos isolados. Todos os isolados carregavam pelo menos blaZ e tetM, demonstrando o transporte conjunto generalizado de vários genes. Os resultados mostram que S. aureus da mastite bovina nesta região tem ampla resistência genotípica aos β-lactâmicos e tetraciclinas, e enfatizam a necessidade de vigilância regional contínua dos determinantes de resistência
Abstract in English:
The emergence and spread of resistance to antimicrobials is one of the three main threats to public health in the 21st century. It must be analyzed using an integrated One Health approach, as it is a health risk shared by people, animals, and the environment. Among these, the necropsy space represents a point of cohesion, being an extremely relevant place for research and understanding the circulation of the bacterial microbiota and its resistance genes. The present study evaluated the occurrence of superbugs in samples from animals necropsied at the Federal Rural University of Rio de Janeiro, considering the priority criteria established by the World Health Organization (WHO). Of the 198 samples collected from 45 animals, 20 pet animals, 20 production animals and three wild animals, 325 strains were isolated, of which 51.38% (167/325) were Enterobacterales, 31.69% (103/325) Staphylococcus spp., 12.62% (41/325) Enterococcus spp., 2.46% (8/325) Streptococcus spp. and 1.85% (6/325) non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB). In 29.13% (30/103) of Staphylococcus spp., the blaZ gene was detected, and in enterobacteria, the presence of blaSHV was detected in 10.18% (17/167), blaTEM in 6.59% (11/167) and blaCTX-M-1 in 4.19% (7/167). These results reveal the occurrence of species characterized as critical superbugs by the WHO in the necropsy environment and reinforce the need to monitor these strains in the veterinary environment not only for the adoption of appropriate control and treatment measures for animals but also for the implementation of protocols safe for the disposal of their carcasses.
Abstract in Portuguese:
O surgimento e a disseminação da resistência aos antimicrobianos é uma das três principais ameaças à saúde pública no século XXI, e deve ser analisado em uma abordagem integrada de Saúde Única, por se tratar de um risco à saúde compartilhado por pessoas, animais e meio ambiente. Dentre estes, o espaço de necropsia representa um ponto de coesão, sendo um local de extrema relevância para pesquisa e compreensão da circulação da microbiota bacteriana e seus genes de resistência. O presente estudo avaliou a ocorrência de superbactérias em amostras de animais necropsiados na Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, considerando os critérios de prioridade estabelecidos pela Organização Mundial de Saúde (OMS). Das 198 amostras coletadas de 45 animais, sendo 20 animais de companhia, 20 de produção e três selvagens, foram isoladas 325 cepas, das quais 51,38% (167/325) foram Enterobacterales, 31,69% (103/325) Staphylococcus spp., 12,62% (41/325) Enterococcus spp., 2,46% (8/325) Streptococcus spp. e 1,85% (6/325) bacilos Gram-negativos não fermentadores (BGNNF). Em 29,13% (30/103) dos Staphylococcus spp. houve detecção do gene blaZ e nas enterobactérias detectou a presença de blaSHV em 10,18% (17/167), blaTEM em 6,59% (11/167) e blaCTX-M-1 em 4,19% (7/167). Esses resultados revelam a ocorrência de espécies caracterizadas como superbactérias críticas pela OMS em ambiente de necropsia e reforçam a necessidade de monitoramento dessas cepas no ambiente veterinário não apenas para a adoção de medidas de controle e tratamento adequados dos animais, mas também para a implementação de protocolos seguros para o descarte de suas carcaças.