Resultado da pesquisa (1)
Termo utilizado na pesquisa Naeem M
#1 - (Online First) Molecular identification and phylogenetic analysis of emerging foot-and-mouth disease virus type O, topotype ME-SA, in the southwestern region of Pakistan
Abstract in English:
Foot-and-mouth disease virus (FMDV) is among the most contagious and economically significant viral pathogens of livestock worldwide. In Quetta, Balochistan, recurrent FMDV outbreaks continue to affect cattle and buffalo populations, yet genomic data on circulating strains remain scarce. This study investigated the molecular characteristics and phylogenetic relationships of FMDV serotypes and topotypes detected during 2021 surveillance in Quetta, Pakistan. Twenty epithelial tissue samples, previously confirmed as FMDV-positive through sandwich ELISA, were analyzed for viral RNA using real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Positive samples underwent VP1 gene sequencing, followed by phylogenetic analysis. FMDV RNA was detected in 80% (16/20; 95% CI: 56%–94%) of samples. Among infected animals, 87.5% were female, 69% were cattle, and most (63%) were aged 1–4 years. The highest number of cases (25%) originated from the Jan Muhammad Road area. Phylogenetic analysis revealed all isolates belonged to FMDV serotype O, topotype Middle East-South Asia (ME-SA). These findings confirm FMDV serotype O (ME-SA) as the dominant strain causing endemic outbreaks in Quetta. Strengthening active surveillance and molecular monitoring systems is crucial for early detection, effective vaccination planning, and regulation of cross-border livestock movement with Afghanistan, Iran, and other regions of Pakistan.
Abstract in Portuguese:
O vírus da febre aftosa (FMDV) está entre os patógenos virais mais contagiosos e economicamente significativos para o gado em todo o mundo. Em Quetta, Balochistão, surtos recorrentes de FMDV continuam a afetar populações de bovinos e búfalos, porém dados genômicos sobre as cepas circulantes ainda são escassos. Este estudo investigou as características moleculares e as relações filogenéticas dos sorotipos e topótipos de FMDV detectados durante uma vigilância realizada em 2021 em Quetta, Paquistão. Vinte amostras de tecido epitelial, previamente confirmadas como FMDV-positivas por ELISA sanduíche, foram analisadas quanto ao RNA viral usando reação em cadeia da polimerase com transcrição reversa em tempo real (RT-PCR). As amostras positivas foram submetidas ao sequenciamento do gene VP1, seguido de análise filogenética. RNA do FMDV foi detectado em 80% (16/20; IC 95%: 56%–94%) das amostras. Entre os animais infectados, 87,5% eram fêmeas, 69% eram bovinos e a maioria (63%) tinha entre um e quatro anos de idade. O maior número de casos (25%) se originou da área da Jan Muhammad Road. A análise filogenética revelou que todos os isolados pertenciam ao sorotipo O do FMDV, topotipo Middle East-South Asia (ME-SA). Esses achados confirmam que o sorotipo O do FMDV (ME-SA) é a cepa dominante que causa surtos endêmicos em Quetta. Fortalecer a vigilância ativa e os sistemas de monitoramento molecular é crucial para a detecção precoce, planejamento eficaz da vacinação e regulamentação do movimento transfronteiriço de animais com o Afeganistão, Irã e outras regiões do Paquistão.
