Resultado da pesquisa (444)
Termo utilizado na pesquisa Bacteria
#1 - Carbapenem resistance and ESBL production in the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex in animals: challenges in resistance identification and diagnosis
Abstract in English:
The Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii (Acb) complex is a major concern in veterinary medicine due to its intrinsic resistance to various antimicrobial agents, including ampicillin, amoxicillin, amoxicillin-clavulanate, and carbapenems. The increasing prevalence of multidrug-resistant (MDR) strains, particularly those producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBLs) and carbapenemases, has been observed in animals, with a significant number of urinary tract infections being associated with these pathogens. The present study identified Acb complex strains harboring one or more resistance genes for ESBL and carbapenemase production, highlighting the growing issue of bacterial resistance in veterinary clinical practice. Phenotypic resistance profiling revealed that some Acinetobacter complex strains can hydrolyze a wide range of beta-lactams, including penicillins and third- and fourth-generation cephalosporins, while remaining resistant to cephamycins and carbapenems. Most of the ESBLs belong to Ambler’s class A, and these enzymes can be inhibited by clavulanic acid, sulbactam, tazobactam, and avibactam. The spread of these resistant strains is largely attributed to clonal expansion and horizontal gene transfer, with CTX-M, SHV, and TEM-derived ESBLs being the most clinically significant. Despite advances in molecular diagnostic methods, correlating phenotypic and genotypic data remains a significant challenge. The present findings highlight discrepancies between the phenotypic resistance patterns and the presence of resistance genes, illustrating the complexity of diagnosing and treating infections caused by Acinetobacter species. Further studies are necessary to better understand the mechanisms of resistance, improve diagnostic accuracy, and address the increasing threat of MDR bacteria in the veterinary field.
Abstract in Portuguese:
O complexo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii (Acb) é uma grande preocupação na medicina veterinária devido à sua resistência intrínseca a diversos agentes antimicrobianos, incluindo ampicilina, amoxicilina, amoxicilina-clavulanato e carbapenêmicos. A crescente prevalência de cepas multirresistentes (MDR), especialmente aquelas produtoras de beta-lactamases de espectro estendido (ESBLs) e carbapenemases, tem sido observada em animais, com um número significativo de infecções do trato urinário associadas a esses patógenos. O presente estudo identificou cepas do complexo Acb que abrigam um ou mais genes de resistência responsáveis pela produção de ESBLs e carbapenemases, destacando o crescente problema da resistência bacteriana na prática clínica veterinária. A análise fenotípica da resistência revelou que algumas cepas do complexo Acinetobacter são capazes de hidrolisar uma ampla gama de beta-lactâmicos, incluindo penicilinas e cefalosporinas de terceira e quarta geração, permanecendo resistentes às cefamicinas e aos carbapenêmicos. A maioria das ESBLs pertence à classe A de Ambler, e essas enzimas podem ser inibidas por ácido clavulânico, sulbactam, tazobactam e avibactam. A disseminação dessas cepas resistentes é atribuída, em grande parte, à expansão clonal e à transferência horizontal de genes, sendo as ESBLs derivadas dos genes CTX-M, SHV e TEM as mais clinicamente relevantes. Apesar dos avanços nos métodos moleculares de diagnóstico, correlacionar os dados fenotípicos e genotípicos ainda é um grande desafio. Os achados deste estudo evidenciam discrepâncias entre os padrões fenotípicos de resistência e a presença de genes de resistência, ilustrando a complexidade do diagnóstico e tratamento de infecções causadas por espécies de Acinetobacter. Estudos adicionais são necessários para compreender melhor os mecanismos de resistência, melhorar a precisão diagnóstica e enfrentar a crescente ameaça das bactérias multirresistentes no campo veterinário.
#2 - Mass spectrometry-based identification reveals the complexity of microorganisms involved in umbilical infections in lambs clinically scored
Abstract in English:
We investigated the microbiological etiology of umbilical infections in clinically scored lambs. A total of 128 lambs showing signs of umbilical infection and 41 showing no umbilical signs were sampled. All microorganisms were identified by mass spectrometry (MALDI-TOF MS), and the in vitro antimicrobial susceptibility/resistance patterns of bacteria were assessed. Among the diseased animals and those without umbilical signs, 214 and 116 species of microorganisms (bacteria and yeasts) were identified, respectively. Escherichia coli (11.21%) was the most prevalent microorganism and showed a significant association (p = 0.0039) with moderate (score 2) and severe (score 3) scores for umbilical infection. In lambs without clinical signs of umbilical infection, a predominance of Desemzia incerta was observed. Diseased lambs that exhibited clinical complications showed a high mortality rate (58%). Additionally, a significant association (p < 0.001) was observed between moderate and severe scores and poor prognosis. Bacterial multidrug resistance was observed in 20% (36/182) of isolates. To our knowledge, some bacteria were identified for the first time as primary agents of umbilical infections in lambs, and clinical scoring was applied for the first time in newborn lambs with omphalopathies. Our findings reveal a high complexity of microorganisms in umbilical infections in lambs, identified by mass spectrometry, with a predominance of E. coli in cases of moderate to severe severity scores, and an association between clinical complications and high mortality.
Abstract in Portuguese:
A etiologia microbiana das infecções umbilicais em cordeiros, com avaliação dos escores de gravidade clínica, foi investigada em 128 animais com sinais de infecção umbilical e 41 aparentemente sadios. Todos os microrganismos foram identificados por espectrometria de massas (MALDI-TOF MS), assim como foi investigado o perfil in vitro de sensibilidade/resistência aos antimicrobianos dos isolados bacterianos. Nos animais com e sem infecção umbilical foram identificadas 214 e 116 espécies de microrganismos (bactérias e leveduras), respectivamente. Escherichia coli (11,21%) foi o microrganismo mais prevalente e mostrou associação significante (p = 0,0039) com escores moderados (escore 2) e graves (escore 3) para infecção umbilical. Em cordeiros sem sinais clínicos de infecção umbilical observou-se o predomínio de Desemzia incerta. Cordeiros com infecção umbilical que apresentaram complicações clínicas apresentaram elevada mortalidade (58%). Foi observada ainda associação significante (p < 0,001) entre escores de gravidade clínica moderado e grave e prognóstico desfavorável. A multirresistência bacteriana foi observada em 20% (36/182) dos isolados. Na literatura consultada, certas bactérias foram identificadas pela primeira vez como agentes primários de infecções umbilicais em cordeiros, bem como escores de gravidade clínica foram adotados pioneiramente em cordeiros neonatos com onfalopatias. O presente estudo revelou alta complexidade de microrganismos nas infecções umbilicais em cordeiros indetificados por espectrometria de massas, com predomínio de E. coli nos casos moderados e graves e alta taxa de mortalidade nas infecções umbilicais com complicações clínicas.
#3 - Bacterial and viral agents in cattle with and without respiratory signs in dairy herds from São Paulo and Rio Grande do Sul states, Brazil
Abstract in English:
Bovine respiratory disease is a multifactorial syndrome of complex etiology, involving interactions among bacterial and viral agents, and has a significant impact on the cattle industry worldwide. This study aimed to identify agents associated with respiratory infections in dairy herds in São Paulo (SP) and Rio Grande do Sul (RS) states. Nasal swabs obtained from animals with and without nasal/respiratory signs in 10 herds in SP (n = 178) and nine herds in RS (n = 273) were submitted to nucleic acid extraction and to endpoint multiplex reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR)/PCR assays for bacterial and viral agents. The bacterial multiplex PCR covers four bacteria (Histophilus somni, Mannheimia haemolytica, Mycoplasma bovis and Pasteurella multocida); the viral multiplex encompasses seven viruses (bovine herpesvirus 1 – BoAHV-1; bovine viral diarrhea virus 1 and 2 – BVDV-1, BVDV-2; HoBi-like pestivirus – HoBiPeV; bovine respiratory syncytial virus – BRSV; bovine parainfluenza 3 virus – BPIV-3 and bovine coronavirus – BCoV). The overall frequency of positive samples was 23.7% (107/451) and the most frequently detected agents were H. somni (30.8%, 33/107) and M. bovis (21.5%, 23/107), followed by BCoV (19.6%, 21/107), BPIV-3 (13.1%, 14/107), M. haemolytica (11.2%, 12/107) and BRSV (9.3%, 10/107). Mixed infections were detected in 13.1% samples (14/107), especially involving bacteria of the Pasteurellaceae family, but also BCoV and BRSV. Considering herd prevalence, H. somni was detected in 57.9% herds (11/19), M. bovis in 52.6% (10/19), M. haemolytica in 42.1% (8/19), BPIV-3 in 36.8% (7/19), BCoV in 26.3% (5/19), BoAHV-1 and BRSV in 21% (4/19), P. multocida in 15.8% (3/19) and BVDV in 5.3% (1/19) herds. Overall, these results offer an overview of the main viral and bacterial agents associated with respiratory infection in dairy herds in the studied regions (SP and RS). In addition, the complex etiology of respiratory disease in cattle highlights the importance of employing multi-etiological diagnostic approaches for comprehensive and accurate investigation.
Abstract in Portuguese:
A doença respiratória bovina é uma síndrome multifatorial de etiologia complexa que envolve interações entre agentes bacterianos e virais, com impacto significativo na indústria pecuária mundial. Este estudo teve como objetivo identificar os agentes relacionados à infecção respiratória em rebanhos leiteiros nos estados de São Paulo (SP) e Rio Grande do Sul (RS). Suabes nasais obtidos de animais com ou sem sinais nasais/respiratórios em dez rebanhos em SP (n = 178) e nove rebanhos no RS (n = 273) foram submetidos à extração de ácidos nucleicos e a testes de transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (RT-PCR)/PCR multiplex convencional para agentes bacterianos e virais. O PCR multiplex bacteriano abrange quatro espécies de bactérias (Histophilus somni, Mannheimia haemolytica, Mycoplasma bovis e Pasteurella multocida); o multiplex viral é capaz de detectar sete vírus (herpesvírus bovino 1 – BoAHV-1; vírus da diarreia viral bovina 1 e 2 – BVDV-1, BVDV-2; pestivírus HoBi-like – HoBiPeV; vírus sincicial respiratório bovino – BRSV; vírus da parainfluenza bovina 3 – BPIV-3 e coronavírus bovino – BCoV). A frequência de amostras positivas foi de 23,7% (107/451) e os agentes mais frequentemente detectados foram H. somni (30,8%; 33/107) e M. bovis (21,5%; 23/107), seguidos por BCoV (19,6%; 21/107), BPIV-3 (13,1%; 14/107), M. haemolytica (11,2%; 12/107) e BRSV (9,3%; 10/107). Infecções mistas foram detectadas em 13,1% das amostras (14/107), especialmente envolvendo bactérias da família Pasteurellaceae, mas também BCoV e BRSV. Considerando a prevalência de rebanhos, H. somni foi detectado em 57,9% dos rebanhos (11/19), M. bovis em 52,6% (10/19), M. haemolytica em 42,1% (8/19), BPIV-3 em 36,8% (7/19), BCoV em 26,3% (5/19), BoAHV-1 e BRSV em 21% (4/19), P. multocida em 15,8% (3/19) e BVDV em 5,3% (1/19) dos rebanhos. No geral, esses resultados fornecem uma visão geral dos principais agentes virais e bacterianos associados com infecção respiratória em rebanhos leiteiros nas regiões estudadas (SP e RS). Além disso, a etiologia complexa das doenças respiratórias em bovinos justifica o uso abordagens diagnósticas multietiológicas, capazes de fornecer um diagnóstico mais abrangente e preciso.
#4 - Detection of ESBL-producing strains at the veterinary necropsy environment
Abstract in English:
The emergence and spread of resistance to antimicrobials is one of the three main threats to public health in the 21st century. It must be analyzed using an integrated One Health approach, as it is a health risk shared by people, animals, and the environment. Among these, the necropsy space represents a point of cohesion, being an extremely relevant place for research and understanding the circulation of the bacterial microbiota and its resistance genes. The present study evaluated the occurrence of superbugs in samples from animals necropsied at the Federal Rural University of Rio de Janeiro, considering the priority criteria established by the World Health Organization (WHO). Of the 198 samples collected from 45 animals, 20 pet animals, 20 production animals and three wild animals, 325 strains were isolated, of which 51.38% (167/325) were Enterobacterales, 31.69% (103/325) Staphylococcus spp., 12.62% (41/325) Enterococcus spp., 2.46% (8/325) Streptococcus spp. and 1.85% (6/325) non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB). In 29.13% (30/103) of Staphylococcus spp., the blaZ gene was detected, and in enterobacteria, the presence of blaSHV was detected in 10.18% (17/167), blaTEM in 6.59% (11/167) and blaCTX-M-1 in 4.19% (7/167). These results reveal the occurrence of species characterized as critical superbugs by the WHO in the necropsy environment and reinforce the need to monitor these strains in the veterinary environment not only for the adoption of appropriate control and treatment measures for animals but also for the implementation of protocols safe for the disposal of their carcasses.
Abstract in Portuguese:
O surgimento e a disseminação da resistência aos antimicrobianos é uma das três principais ameaças à saúde pública no século XXI, e deve ser analisado em uma abordagem integrada de Saúde Única, por se tratar de um risco à saúde compartilhado por pessoas, animais e meio ambiente. Dentre estes, o espaço de necropsia representa um ponto de coesão, sendo um local de extrema relevância para pesquisa e compreensão da circulação da microbiota bacteriana e seus genes de resistência. O presente estudo avaliou a ocorrência de superbactérias em amostras de animais necropsiados na Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, considerando os critérios de prioridade estabelecidos pela Organização Mundial de Saúde (OMS). Das 198 amostras coletadas de 45 animais, sendo 20 animais de companhia, 20 de produção e três selvagens, foram isoladas 325 cepas, das quais 51,38% (167/325) foram Enterobacterales, 31,69% (103/325) Staphylococcus spp., 12,62% (41/325) Enterococcus spp., 2,46% (8/325) Streptococcus spp. e 1,85% (6/325) bacilos Gram-negativos não fermentadores (BGNNF). Em 29,13% (30/103) dos Staphylococcus spp. houve detecção do gene blaZ e nas enterobactérias detectou a presença de blaSHV em 10,18% (17/167), blaTEM em 6,59% (11/167) e blaCTX-M-1 em 4,19% (7/167). Esses resultados revelam a ocorrência de espécies caracterizadas como superbactérias críticas pela OMS em ambiente de necropsia e reforçam a necessidade de monitoramento dessas cepas no ambiente veterinário não apenas para a adoção de medidas de controle e tratamento adequados dos animais, mas também para a implementação de protocolos seguros para o descarte de suas carcaças.
#5 - Mass spectrometry-based identification of 26 Pasteurella species and in vitro antimicrobial susceptibility pattern of isolates recovered from diseased domestic cats
Abstract in English:
Pasteurella species are well-known opportunistic bacteria that inhabit the microbiota of the oral cavity and upper respiratory tract of cats and have been related to a set of pet-associated diseases in addition to humans. Most studies involving feline pasteurellosis have been described as case reports and species identification based on classic phenotypic methods. In turn, a lack of comprehensive studies involving a great number of cats with pasteurellosis has been described, especially where diagnosis at the species level has been performed by molecular-based methods. In this scenario, we investigated the molecular identification of Pasteurella species isolated from 26 diseased domestic cats (i.e., cutaneous abscesses, pneumonia, conjunctivitis, open wounds, urinary tract infections, pleural effusion, pyometra, and infection secondary to neoplasia) based on proteomic diagnosis, using mass spectrometry (matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). The in vitro antimicrobial susceptibility patterns of isolates and selected epidemiological data (with emphasis on the outcome) were assessed as well. MALDI-TOF MS identified predominantly P. multocida (23/26=88.5%), followed by P. dagmatis (2/26=7.7%) and P. canis (1/26=3.8%). The isolates revealed 100% susceptibility to beta-lactams (amoxicillin/clavulanic acid, ampicillin, cephalexin, ceftriaxone), tetracyclines (tetracycline, doxycycline) and fluoroquinolones (ciprofloxacin, levofloxacin, marbofloxacin) groups of antimicrobials. Conversely, the highest resistance of the isolates was observed for amikacin (10/26=38%). Data on outcomes were available for 61% (16/26) of cats, of which 50% (8/16) died or were subjected to euthanasia due to severe complications (e.g., sepsis, pneumonia, and pleural effusion) secondary to disseminated/systemic infections, although no significant association was observed between Pasteurella species and the clinical-epidemiological findings studied. Our results contribute to the molecular identification of Pasteurella species and vigilance of multidrug-resistant bacteria that infect cats. Also, it highlights the need for the early diagnosis and therapy of feline pasteurellosis due to high mortality rates.
Abstract in Portuguese:
As espécies de Pasteurella são bactérias oportunistas que habitam a microbiota da cavidade oral e do trato respiratório superior de gatos, relacionadas a vários sinais clínicos em animais de companhia e humanos. A maioria dos estudos envolvendo pasteurelose felina têm sido descritos como relatos de casos, e a identificação de espécies baseada em métodos clássicos de classificação fenotípica. No entanto, número restrito de estudos têm focado grande número de gatos com pasteurelose, nos quais métodos moleculares tenham sido utilizados para o diagnóstico dos patógenos em nível da espécie. Neste cenário, foi investigada a identificação molecular de espécies de Pasteurella isoladas de 26 gatos domésticos com diferentes manifestações clínicas (e.g., abscessos cutâneos, pneumonia, conjuntivite, feridas, infecções do trato urinário, derrame pleural, piometra e infecção secundária à neoplasia), com base no diagnóstico por proteômica, utilizando a espectrometria de massas (Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry – MALDI-TOF MS). O perfil de sensibilidade microbiana in vitro dos isolados e dados epidemiológicos dos animais (com ênfase no desfecho dos casos) também foram avaliados. MALDI-TOF MS identificou predominantemente P. multocida (23/26=88,5%), seguido por P. dagmatis (2/26=7,7%) e P. canis (1/26=3,8%). Os isolados revelaram 100% de sensibilidade aos grupos de antimicrobianos beta-lactâmicos (amoxicilina/ácido clavulânico, ampicilina, cefalexina, ceftriaxona), tetraciclinas (tetraciclina, doxiciclina) e fluoroquinolonas (ciprofloxacino, levofloxacino, marbofloxacino). Por outro lado, a maior resistência dos isolados foi observada para a amicacina (10/26=38%). Os dados de desfecho estavam disponíveis para 61% (16/26) dos gatos, dos quais 50% (8/16) morreram ou foram submetidos à eutanásia devido a graves complicações secundárias a infecções disseminadas/sistêmicas, embora nenhuma associação estatística tenha sido observada entre as espécies de Pasteurella e os achados clínico-epidemiológicos estudados. Os resultados do presente estudo contribuem para a identificação molecular de espécies de Pasteurella e para a vigilância de bactérias multirresistentes que infectam gatos, indicando a necessidade de diagnóstico e tratamento precoces da pasteurelose felina devido às altas taxas de mortalidade.
#6 - Bacterial pattern of lower respiratory diseases in horses
Abstract in English:
Bacterial infections of the lower respiratory tract in horses are often caused by multiple etiological agents. Transtracheal aspirate followed by bacterial culture is crucial for diagnosing bacterial causes of these infections. This retrospective study investigated bacterial cultures from transtracheal aspirates of 40 horses with lower respiratory diseases admitted to the Large Animal Hospital at FMVZ-Unesp, Botucatu/SP. Medical records of these horses were reviewed, and transtracheal aspirates were cultured and tested for antimicrobial sensitivity. Of the 40 cultures, 27 were mono-infections, and 13 were mixed infections. The most commonly isolated bacteria in monoinfections were Streptococcus equi (37%), Rhodococcus equi (26%), and α-hemolytic streptococci (11%). Escherichia coli was the predominant in mixed infections (69%). No strictly anaerobic bacteria were isolated. The most effective antimicrobials were azithromycin (92%), ceftiofur (72%), and gentamicin (72%), while higher resistance of isolates was noted for penicillin G (53%) and ampicillin (50%). Additionally, 36% of isolates were multidrug-resistant. This study underscores the diverse bacterial etiology and presence of multidrug-resistant isolates in lower respiratory infections in horses.
Abstract in Portuguese:
Infecções bacterianas do trato respiratório inferior em equinos são frequentemente causadas por múltiplos agentes etiológicos. A coleta de aspirado transtraqueal seguida por cultura bacteriana é crucial para o diagnóstico dos agentes bacterianos envolvidos com essa infecção. Este estudo retrospectivo investigou culturas bacterianas de aspirados transtraqueais de 40 cavalos com doenças do trato respiratório inferior admitidos na Clínica de Grandes Animais do Hospital Veterinário da FMVZ-Unesp, Botucatu/SP. Os prontuários médicos desses equinos foram revisados, e os aspirados transtraqueais foram cultivados e testados para sensibilidade antimicrobiana. Das 40 culturas, 27 foram mono-infecções e 13 foram infecções mistas. As bactérias mais comumente isoladas em mono-infecções foram Streptococcus equi (37%), Rhodococcus equi (26%) e α-hemolytic streptococci (11%). Escherichia coli foi predominante nas infecções mistas (69%). Nenhuma bactéria estritamente anaeróbica foi isolada. Os antimicrobianos mais eficazes foram azitromicina (92%), ceftiofur (72%) e gentamicina (72%), enquanto maior resistência dos isolados foi observada para penicilina G (53%) e ampicilina (50%). Além disso, 36% dos isolados foram multirresistentes. Este estudo destaca a etiologia bacteriana diversificada e a presença de isolados multirresistentes em infecções respiratórias inferiores em equinos.
#7 - Investigation of some parasitic, bacterial and BVDV agents in dairy cows based on a past of abortions
Abstract in English:
Blood samples were taken from 94 dairy cows based on a past of abortions (4th-7th months) in four different farms in Burdur province. The presence of Chlamydophila abortus (Antibody = Ab), Coxiella burnetti (Ab), Sarcocystis spp. (Ab), Neospora caninum (Ab) and bovine viral diarrhea virus (BVDV) (Antigen = Ag) were investigated in the collected blood samples. While seropositivity was determined for C. abortus, C. burnetti and N. caninum in the samples, BVDV was detected positive in the same samples. No samples were detected seropositive for Sarcocystis spp. (Ab). N. caninum showed the highest seropositivity in the samples tested, whereas C. burnetti had the lowest. When we looked at the mixed distribution of the factors in the positive animals, C. abortus + N. caninum was found to be the highest, and C. burnetti + N. caninum was the lowest. As a result of the study, it was determined that N. caninum was the most common abortion factor in cattle that had abortions between 4-7 months, and BVDV, C. abortus and C. burnetti, respectively, could also cause abortion. The high level of N. caninum indicates that canes and underground spring waters around the farms may be important reservoirs.
Abstract in Portuguese:
Blood samples were taken from 94 dairy cows based on a past of abortions (4th-7th months) in four different farms in Burdur province. The presence of Chlamydophila abortus (Antibody = Ab), Coxiella burnetti (Ab), Sarcocystis spp. (Ab), Neospora caninum (Ab) and bovine viral diarrhea virus (BVDV) (Antigen = Ag) were investigated in the collected blood samples. While seropositivity was determined for C. abortus, C. burnetti and N. caninum in the samples, BVDV was detected positive in the same samples. No samples were detected seropositive for Sarcocystis spp. (Ab). N. caninum showed the highest seropositivity in the samples tested, whereas C. burnetti had the lowest. When we looked at the mixed distribution of the factors in the positive animals, C. abortus + N. caninum was found to be the highest, and C. burnetti + N. caninum was the lowest. As a result of the study, it was determined that N. caninum was the most common abortion factor in cattle that had abortions between 4-7 months, and BVDV, C. abortus and C. burnetti, respectively, could also cause abortion. The high level of N. caninum indicates that canes and underground spring waters around the farms may be important reservoirs.
#8 - Global distribution of antimicrobial resistance in pathogenic Escherichia coli isolated from calves: a systematic review
Abstract in English:
The present study aimed to perform a systematic review to determine the antimicrobial resistance (AMR) profile of pathogenic Escherichia coli strains isolated from the intestinal tract of calves worldwide. Six databases were systematically searched (CABI, Cochrane, PubMed, SciELO, Scopus and Web of Science) with no restrictions regarding the year or place of the publications. A total of 932 studies were recovered, and 56 articles, published from 1982 to 2020, were included in this systematic review. These articles were selected based on title, abstract and full text. The most used technique to determine the susceptibility to antimicrobials of E. coli strains was the disk diffusion test (83.93%, 47/56), followed by the minimum inhibitory concentration (MIC) test (19.64%, 11/56). Only two studies (3.57%, 2/56) performed both tests. Seventy-seven different antimicrobial drugs of 17 classes were tested using disk diffusion methodology. For the MIC, fifteen antimicrobial classes and sixty-one antimicrobial drugs were tested. Cephalosporins were the most tested antimicrobial class, both by disk diffusion and MIC methods. Antimicrobial classes with the highest resistance levels were observed for tetracyclines, penicillins, folate inhibitors, aminoglycosides, phenicols and fluoroquinolones. Due to the heterogeneity and low quality of the studies, mainly regarding the antimicrobial susceptibility test methodology used, it was not possible to perform a meta-analysis. The findings showed the global spread of antimicrobial resistance in pathogenic E. coli from calves and indicate the importance of carrying out studies based on well-designed analyses to better understand the real emergence and spread of AMR in this pathogen.
Abstract in Portuguese:
O presente estudo teve como objetivo realizar uma revisão sistemática para determinar o perfil de resistência antimicrobiana (RAM) de cepas patogênicas de Escherichia coli isoladas do trato intestinal de bezerros em todo o mundo. Foram pesquisadas sistematicamente seis bases de dados (CABI, Cochrane, PubMed, SciELO, Scopus e Web of Science) sem restrições quanto ao ano ou local das publicações. Foram recuperados 932 estudos, e 56 artigos, publicados entre 1982 e 2020, foram incluídos nesta revisão sistemática. Esses artigos foram selecionados com base no título, resumo e texto completo. A técnica mais utilizada para determinar a suscetibilidade aos antimicrobianos de cepas de E. coli foi o teste de difusão em disco (83,93%, 47/56), seguido pelo teste de concentração inibitória mínima (CIM) (19,64%, 11/56). Apenas dois estudos (3,57%, 2/56) realizaram ambos os testes. Setenta e sete diferentes antimicrobianos de 17 classes foram testados usando a metodologia de difusão em disco. Para o MIC, foram testadas quinze classes antimicrobianas e sessenta e um fármacos antimicrobianos. As cefalosporinas foram a classe antimicrobiana mais testada, tanto pelos métodos de difusão em disco quanto pelo MIC. As classes antimicrobianas com maiores níveis de resistência foram observadas para tetraciclinas, penicilinas, inibidores de folato, aminoglicosídeos, fenicóis e fluoroquinolonas. Devido à heterogeneidade e baixa qualidade dos estudos, principalmente quanto à metodologia de teste de suscetibilidade antimicrobiana utilizada, não foi possível realizar uma meta-análise. Os achados mostraram a disseminação global da resistência antimicrobiana em E. coli patogênica de bezerros e indicam a importância da realização de estudos baseados em análises bem delineadas para melhor compreender a real emergência e disseminação da RAM neste patógeno.
#9 - Leukofiltration enhances Escherichia coli control in equine blood bags
Abstract in English:
Leukoreduction by filtration (LRF) is widely used in human blood banks to reduce the transmission of infectious agents, including viruses, bacteria, and blood parasites. This study evaluated the efficiency of LRF in controlling Escherichia coli contamination in equine blood bags over 14 days of storage. This in vitro experimental study utilised blood samples inoculated with E. coli. Blood samples (450 mL per bag) were obtained from six hematologically stable horses. Fourteen equine blood bags were divided into control (unfiltered) and experimental (with a leukocyte filter) groups. Whole blood bags were refrigerated for two hours at 2-6 °C, after which each bag was inoculated with 1 mL of E. coli. The experimental group underwent bedside leukocyte filtration using pre-filters. Blood count, osmotic fragility, percentage of hemolysis, bacterial culture, and serum potassium, protein, albumin, and glucose levels were analysed. Tukey’s and Pearson’s chi-square tests were applied, with significance at p-value < 0.05 and 95% confidence interval. The filtered group showed an immediate 65.5% reduction in bacterial load, reaching 97.01% by day 14, compared to 72.99% in the control group. Although both groups showed a reduction in bacterial load during the 14 days of storage, the data indicate that filtration significantly contributed to a more rapid and pronounced decrease in E. coli. The main limitations were a small sample size (14 blood bags) and a relatively short storage period (14 days), limiting the study’s generalizability and reducing its statistical power. Human leukocyte filtration efficiently reduces E. coli contamination in equine blood, without affecting red blood cell count or osmotic fragility. The findings suggest that leukoreduction may act as a complementary method to refrigeration in bacterial control of equine blood bags. Nevertheless, further studies with greater statistical power and extended storage durations are recommended.
Abstract in Portuguese:
A leucorredução por filtração (LRF) é um procedimento comum em bancos de sangue humano e também tem sido usada para reduzir a transmissão de agentes infecciosos como vírus, bactérias e parasitas sanguíneos. Este estudo teve como objetivo avaliar a eficiência da leucorredução por filtração no controle quantitativo de Escherichia coli inoculadas em bolsas de sangue equino durante 14 dias de armazenamento. Amostras de sangue de aproximadamente 450 ml por bolsa de sangue foram obtidas de seis cavalos hematologicamente estáveis. Quatorze bolsas de sangue equino foram divididas em dois grupos: controle (sem filtração) e experimental (com filtro leucocitário). As bolsas de sangue total foram refrigeradas por duas horas entre 2-6 °C, após cada bolsa foi inoculada com 1 ml de E. coli diluída em caldo Brain Heart Infusion, contendo 1x108 CFU/ml. No grupo experimental foram aplicados filtros leucocitários do tipo beira de leito com pré-filtro. Foram analisados hemograma, fragilidade osmótica, porcentagem de hemólise, cultura bacteriana, dosagens séricas de potássio, proteína, albumina e glicose. Para análise descritiva e comparação de médias entre grupos e entre tempos foram utilizados o teste de Tukey e teste qui-quadrado de Pearson para concentração bacteriana e eficiência de filtração, com significância fixada em valor de p < 0,05 em ambos os testes, sendo o intervalo de confiança de 95% (IC). Observou-se uma redução imediata de 65,5% da carga bacteriana no grupo filtrado, com redução acumulada de 97,01% ao final do período, comparado a 72,99% do grupo controle. O filtro leucocitário humano foi eficiente na leucorredução do sangue total equino inoculado com E. coli, sem redução quantitativa da série vermelha ou aumento da fragilidade osmótica. Embora ambos os grupos tenham apresentado redução na carga bacteriana ao longo dos 14 dias de armazenamento, os dados indicam que a filtração contribuiu significativamente para uma redução mais rápida e acentuada de E. coli. O estudo apresentou número limitado de amostras e período de armazenamento relativamente curto. Ainda assim, os achados sugerem que a leucorredução pode atuar de forma complementar à refrigeração no controle bacteriano em bolsas de sangue equino. Estudos com maior poder estatístico e duração estendida são recomendados para confirmar esses resultados e esclarecer os mecanismos envolvidos.
#10 - Investigation of enterobacteria with zoonotic and multi-resistant potential in exotic parrots kept in a domestic environment
Abstract in English:
This investigation elucidated the presence of potentially zoonotic and antimicrobial-resistant bacteria in domestically reared psittacines. The present study was sanctioned by the Animal Ethics Committee of the State University of Ceará (CEUA-UECE) and bears registration number 03423745/2023. A total of 111 cloacal swab samples were procured from exotic psittacines encompassing six distinct species: the Australian budgerigar (Melopsittacus undulatus), cockatiels (Nymphicus hollandicus), lovebirds (Agapornis sp.), rose-ringed parakeets (Psittacula krameri), red-rumped parrots (Psephotus haematonotus), and rosellas (Platycercus eximius). The process encompassed the isolation and characterization of enterobacteria and ascertaining their resistance profiles. Among the collected specimens, 70.2% (78/111) yielded growth indicative of one or more enterobacterial agents. The collective isolates comprised 110 strains encompassing 13 distinct bacterial species. Foremost among these was Escherichia coli, accounting for a significant percentage of the total isolates at 30% (33/110), followed by Pantoea agglomerans at 27.2% (30/110). The study revealed that 35.4% (39/110) of the isolates exhibited resistance to tobramycin, with tetracycline and fosfomycin showing resistance rates of 34.5% (38/110) and 30.9% (34/110), respectively. Particularly noteworthy was that E. coli showed a heightened propensity for tetracycline resistance at 51.5% (17/33), while resistance rates to tobramycin and gentamicin were 36.6% (12/33) and 15.1% (5/33), respectively. A noteworthy subset of the enterobacterial cohort exhibited multidrug resistance patterns (28.9%, 32/110). Collectively, these outcomes underscore not only an elevated prevalence of enterobacterial strains but also the pervasive phenomenon of antimicrobial resistance across a diverse spectrum of antimicrobial agents.
Abstract in Portuguese:
Este estudo investigou a presença de bactérias potencialmente zoonóticas e resistentes a antimicrobianos em psitacídeos criados em ambiente doméstico. Esse projeto foi aprovado pela Comissão de Ética para o Uso de Animais da Universidade Estadual do Ceará (CEUA-UECE), registrado sob o número 03423745/2023. Foram coletadas 111 amostras de suabes cloacais de psitacídeos exóticos de seis espécies, incluindo, periquitos-australianos (Melopsittacus undulatus), calopsitas (Nymphicus hollandicus), agapornis (Agapornis sp.), periquitos-de-colar (Psittacula krameri), periquitos-dorso-vermelho (Psephotus haematonotus) e roselas (Platycercus eximius). Foi realizado o isolamento e a identificação de enterobactérias e determinado o perfil de resistência. Das amostras coletadas, 70,2% (78/111) apresentaram crescimento para uma ou mais enterobactérias. Foram isoladas 110 cepas pertencentes a 13 espécies bacterianas. Escherichia coli apresentou o maior índice de isolamento, com 30% (33/110). Em segundo lugar Pantoea agglomerans, com um percentual de isolamento de 27,2% (30/110). Observou-se que 35,4% (39/110) das enterobactérias apresentaram resistência à tobramicina, seguidas da tetraciclina com 34,5% (38/110) e da fosfomicina com 30,9% (34/110). E. coli apresentou maior taxa de resistência a tetraciclina com 51,5% (17/33), seguida de 36,6% (12/33) para tobramicina e 15,1% (5/33) para gentamicina. Das enterobactérias analisadas 28,9% (32/110), apresentaram multirresistência. Os resultados indicam uma alta prevalência de enterobactérias, a resistência antimicrobiana foi constatada em diversas classes de antimicrobianos.
